Ali Koç, genel kurul öncesinde yaptığı açıklamalarda, "Bu seçim bizim için yok hükmündedir" diyerek tepkisini dile getirdi. Ayrıca protokolde kendisine ayrılan yerde oturmayı reddeden Koç, bu tutumunu genel kurulda da sürdürdü.
Koç, kürsüde yaptığı konuşmada Mehmet Büyükekşi'yi ağır bir dille eleştirerek, "Yönetim şekli toplumun hiçbir kesiminde kabul görmeyen, tarihin hiçbir sezonunda görülmemiş skandalları tek sezonda yaşatan, hiçbir sorumluluk almayan, Fenerbahçe ve Beşiktaş stadyumlarına gelemeyen bir başkan olmanıza rağmen yine aday olarak çıkmanızı tebrik ederim! Helal olsun. Onurlu, haysiyetli kimse; bu şekilde aday olmaz" ifadelerini kullandı.
Mehmet Büyükekşi, Ali Koç'un sert eleştirilerine cevap vererek, "Koskoca Fenerbahçe Başkanı böyle konuşamaz" dedi. Bu açıklama üzerine Ali Koç, "Son sözümü geri alıyorum. Ancak siz koskoca Fenerbahçe Başkanı ile ilgili devlet nezdinde yalan söylediniz" diyerek tepkisini sürdürdü. Bu sözler genel kurulda kısa süreli bir gerginliğe neden oldu.